Après une tournée d’inspection en Syrie et en Palestine, Septime Sévère se rend en Égypte ; il fait un sacrifice sur la tombe de Pompée à Péluse, est reçu triomphalement à Alexandrie où il reste quelques mois, dotant la ville d'un nouveau temple de Cybèle, de thermes et d'un gymasium. Il introduit un Sénat municipal (Boulè) à Alexandrie et dans les villes principales, et pour la première fois permet à des Égyptiens à accéder au Sénat romain.
Selon la douteuse Histoire Auguste, le préfet du prétoire Plautien et Septime Sévère se brouillent. Ce dernier fait abattre les statues du préfet et le déclare ennemi public. Selon la même source, il se réconcilie avec lui par la suite.